Внедрение методов программно-целевого управления в региональном развитии предполагает существенное изменение формата и более широкое использование такого инструмента, как программы социально-экономического развития регионов и муниципальных образований.

В 2007-2008 гг. в составе консорциума научных организаций Институт принимал участие в разработке Программы социально-экономического развития объединенного Красноярского края на средне- и долгосрочную перспективу. В процессе выработки рекомендаций по оптимизации бюджетной и налоговой политики, межбюджетных отношений объединенного Красноярского края, повышению качества бюджетных услуг, повышению эффективности использования бюджетных средств была проведена оценка существующей бюджетной политики и межбюджетных отношений в крае, предложены варианты такой политики, с учетом как местных особенностей, так и политики федерального центра в области бюджетной реформы и реформы местного самоуправления, а также разработаны рекомендации по изменению краевого законодательства. Были определены цели и задачи бюджетной политики, оценены ресурсы и ограничения достижения поставленных целей, предложены целевые индикаторы их достижения. Совершенствование наиболее эффективных механизмов распределения бюджетных инвестиций, в частности, разработка методологии и критериев оценки их эффективности на региональном и муниципальном уровне, является значимым направлением деятельности для различных сфер государственного управления.

По заказу Минэкономразвития России в 2007 г. Институтом были выполнены работы по теме «Методические рекомендации для субъектов Российской Федерации и муниципальных образований по оценке эффективности планируемых и реализуемых бюджетных инвестиций». В ходе исследования были выявлены и классифицированы проблемы, возникающие при реализации инвестиционной политики в регионах и муниципальных образованиях, а также описана «лучшая практика» решений в области оценки эффективности бюджетных инвестиций.

Учитывая полученные результаты, был разработан типовой порядок и критерии оценки эффективности планируемых и реализуемых бюджетных инвестиций в субъектах Федерации и муниципальных образованиях.

В 2010 г. по заказу Администрации города Хабаровска Институт подготовил проект раздела, посвященного долгосрочному бюджетному планированию, в Стратегический план устойчивого развития города Хабаровска до 2020 года.

Одним из наиболее острых вопросов регионального развития остается вопрос определения подходов к типологизации регионов и возможности учета типов субъектов Российской Федерации при реализации государственной политики.

Институтом в 2006 г. в контексте Всероссийской конференции «Стратегия регионального развития Российской Федерации» по заказу Минрегиона России была подготовлена аналитическая записка о взаимосвязи типов регионов, процессов социально-экономического развития субъектов Российской Федерации и показателей унифицированной системы показателей. Исследовалась возможность построения типологии субъектов Российской Федерации на основе показателей социально-экономического развития, характеризующих динамику таких глобальных процессов, как неоиндустриализация, урбанизация, глобализация и pегионализация. В рамках данного исследования были рассмотрены различные подходы к определению мировых глобальных процессов, выделены значимые характеристики, с помощью которых можно их описать, разработана система показателей, характеризующих динамику процессов. По материалам исследования был проведен круглый стол «Типология субъектов Российской Федерации с точки зрения регионального развития» и выпущен сборник с одноименным названием.

В 2008 г. по заказу Департамента экономической политики и развития города Москвы Институт разработал реестр государственных услуг, порядок ведения такого реестра, а также порядок формирования паспортов государственных услуг, включающий показатели, характеризующие каждую услугу исходя из правовых норм, категорий пользователей и объемов услуг в стоимостном и натуральном выражениях. Указанные документы разработаны в виде проектов нормативных правовых актов Москвы. Реализация предложенных в проектах решений позволит создать современную систему финансового обеспечения государственных услуг города Москвы.

По заказу Минэкономразвития России в 2007 г. Институтом были определены критерии выделения грантов, разработаны рекомендации по определению объема средств и выбору формы для выделения грантов субъектам Российской Федерации. Были предложены варианты расчета интегральной оценки, учитывающей как показатели деятельности органов исполнительной власти, так и объективные условия социально-экономического развития регионов.